1、涉及公司内部关系的纠纷，主要有公司利润分配纠纷、隐名股东行使股东权利纠纷、对内承担责任纠纷、出资纠纷等。在处理公司内部关系引发的纠纷时，主要应遵循契约自由、意思自治的原则。隐名股东与显名股东就权利义务分配达成的契约与一般的民事契约没有本质区别，只要双方意思一致且不违反法律法规的强制性规定，就应对双方具有约束力。其中，又分为两种情况：

　　第一，公司其他股东对隐名投资情况完全了解，则隐名股东随时有权以显名股东为被告向法院起诉确认其股东身份，并依法院的生效法律文书来要求工商登记部门办理变更登记。但如果隐名股东出资违反了法律的禁止性规定，则应认定其行为无效，当事人之间的法律责任按法律关于无效合同的规定办理。此时隐名股东只能向显名股东主张债权。

　　第二，公司其他股东对隐名投资情况并不知情，而此时隐名股东主张确认股权的，是否应当予以确认。可参照公司股权转让的规定，如果其他股东过半数同意隐名股东成为实际股东的，可申请法院判决确认。但是，如果公司章程对股权转让有其他约定的，应按照章程的规定。

　　2、涉及公司外部关系的纠纷，主要有对外被视为公司的股东主体问题、隐名股东或显名股东向外转让股权纠纷等等。在处理公司外部法律关系时，则应遵循公示主义原则和外观主义原则，维护交易秩序和安全，保护善意第三人利益。在处理这类纠纷时，对隐名股东的资格认定应以形式为准，凡是已经工商登记的事项，除有确凿的证据证明属于虚假陈述外，均推定为真实事项并具有法律上的公信力，隐名股东对确信登记真实而进行交易的第三人不得以具备股东实质特征对抗，以此维护交易安全与效率。

　　值得注意的是，如果盗用他人名义或以根本不存在的人的名义作为显名股东的，被盗名者不具有股东资格，股东资格仍应有实际出资人或直接责任人享有。